Mit der richtigen Pflege werden Besitzer von Wasserbetten lange Jahre Freude mit ihrer neuen Anschaffung haben. Der Aufwand, der hierfür aufgebracht werden muss, hält sich dabei in Grenzen. Die meiste Arbeit ist bereits mit dem richtigen Befüllen des Wasserbetts getan. Wenn das Wasserbett zum ersten Mal befüllt wird, wird dem Wasser ein spezieller Conditioner beigefügt. Dieser sorgt dafür, dass das Wasser hygienisch frisch bleibt und sich keine Blasen bilden.
Das Wasser muss nicht jährlich erneuert werden, wenn ein Conditioner enthalten ist. Dadurch reduziert sich der Pflegeaufwand zusätzlich. Möglicherweise kann es notwendig sein, von Zeit zu Zeit etwas Wasser aufzufüllen. Einmal jährlich wird dann erneut eine Portion Conditioner in das Wasser der Matratze gegeben. Ein komplettes Auswechseln des Wassers ist damit nur alle zwei bis drei Jahre notwendig.
Die Pflege von außen gestaltet sich denkbar einfach. Die Vinylbezüge der Matratze lassen sich einfach mit einem feuchten Tuch abwischen. Der Zusatz eines Reinigungsmittels ist nicht notwendig, klares Wasser und am besten ein Microfasertuch sind völlig ausreichend. Mit einem Microfasertuch kann nebelfeucht gewischt werden, damit der Bezug schneller wieder abtrocknet und neu bezogen werden kann. Das kann wöchentlich geschehen oder im Abstand von zwei Wochen. Das kommt auf die Gegebenheiten des Einzelnen an, wie oft eine Reinigung notwendig ist. Einmal im Monat wird die Außenhülle mit einem speziellen Vinylreiniger für Wasserbetten abgewischt. Der Reiniger sollte unbedingt ein Produkt für Wasserbetten sein, denn dieser ist auf die Pflege des Materials abgestimmt. Der Reiniger bewirkt, dass das Material schön geschmeidig bleibt und auch nach vielen Jahren des Gebrauchs nicht damit gerechnet werden muss, dass die Matratze porös wird und ersetzt werden muss.